生化過濾棉過濾器既提供機械過濾也提供生物過濾，空氣注入室會產生微小的氣泡，從而增加氧氣的溶解度。它的多孔特性可幫避免堵塞，並為細硝化細菌提供最大的附著面積。生化過濾器對分解糞便和草料剩餘物具有最佳效果，還可以改善水質，從而降低魚缸中魚類的死亡率。